ラフのレイヤーを２０〜５０％くらいの濃度にし、ラフの上に線画レイヤーを作成して、線画を描き起こしていきます。

ここではラフの線を全部なぞるというより、「線画として欲しい部分を抽出する」ような感じで描いていきます。
後で修正がきくよう、「体」「衣装」「楽器」などというように、パーツごとにレイヤーを分けながら、線画を起こしていきます。

全体の線画を描き終わったら、線画の重なった部分を消していき、線画レイヤーの不透明度を保護しておきます。