キャラクターの周りに白フチを入れます。こうすることで、背景に溶け込んでしまっているキャラクターを浮き立たせることができます。

まず、線画を[マジックワンド]ツールで選択し、線画の下に新規レイヤーを作成します。
そして、[編集]→[選択範囲をふちどり]を実行すると、白フチを入れることができます。

また、[表示]メニューから[透明部分の表示]にチェックを入れたり、アイコンバーの[透明部分の表示]ボタンをONにすることで、原稿上の透明部分に色をつけて表示することができるので、フチを確認しやすくなります。